Polymarket cho biết trong tài liệu về phí giao dịch rằng phần lớn các thị trường trên nền tảng hiện vẫn được miễn phí. Tuy nhiên, đối với các thị trường tiền mã hóa có khung thời gian 15 phút, Polymarket đã áp dụng một khoản phí nhỏ chỉ dành cho bên khớp lệnh (taker). Khoản phí này được sử dụng để tài trợ cho Chương trình Hoàn tiền cho Nhà tạo lập thị trường (Maker Rebates Program).
Theo đó, toàn bộ phí thu được sẽ được phân phối lại hằng ngày bằng USDC cho các nhà tạo lập thị trường, nhằm khuyến khích họ cung cấp thanh khoản. Cơ chế này giúp cải thiện độ sâu thị trường, đồng thời thu hẹp chênh lệch giá mua – bán, từ đó nâng cao hiệu quả giao dịch cho người dùng. Ngoài ra, Polymarket cũng khẳng định rằng các giao dịch nạp và rút USDC trên nền tảng hoàn toàn không bị tính phí, góp phần giảm chi phí tổng thể cho nhà đầu tư.